凍幹機影響幹燥過程的主要因素是升華界麵的溫度(或供熱量)和水蒸汽逸出製品的能力。前者主要由擱板的溫度和幹燥箱的壓力(真空度)所決定，而後者主要由升華界麵的溫度(對應的水蒸汽飽和壓力)和箱內的水蒸汽分壓所決定。因此，要使幹燥過程具有“再現性”，擱板的溫度、幹燥箱的壓力(真空度)和其水蒸汽分壓這三個參數進行“過程控製”，才能使批與批間的製品具有相同的凍幹條件和同樣的質量。
下麵從“過程再現”的角度分別介紹目前所采用的擱板溫度，幹燥箱內壓力(真空度)和水蒸汽分壓的控製。
一、擱板溫度的控製
生物醫藥凍幹機均用電加熱，利用控製電加熱的通斷，可以方便地控製加熱量和溫度。一般采用兩種方式。
階梯式升溫
即將升溫階段分成若幹區段，在每區段開始時接通加熱器升溫。當擱板(介質)溫度達到該段值上*，切斷加熱器，保溫到該段時間結束，再轉入下區段的升溫。此種方式中每區段擱板的升溫速率不進行控製，但因製品升溫滯後於擱板的升溫，因此製品的升溫速率與預定的接近。
跟蹤式升溫
根據製品要求的升溫速率，製定出擱板升溫速率曲線，將實測的擱板升溫速率與對應時刻要求的升溫速率曲線相比較，確定加熱器的通斷時間比例，並不斷修正這個比例使實際升溫曲線跟蹤要求的升溫曲線，這種方式能較準確的進行過程控製。
二、箱內壓力（真空度）的控製
過去人們調控箱內壓力的目的，主要在於提高箱內壓力，可以提高升華界麵允許的zui高溫度和供熱量，從而可加快幹燥的速度。引入“過程再現性”的觀點以後，人們還要用能否獲得“相同的凍幹條件”來重新審視這些方法的優劣。箱內壓力調控的方法主要有：
1、 校下漏孔法
這是目前多數生物、醫藥凍幹機所采用的方法，它是基於提高幹燥塔速率而提出來的。其方法是將無菌空氣(或氣體，下同)引入幹燥箱和冷阱，在冷阱的冷凝表麵上形成一層空氣膜，因而水蒸汽的凝結阻力增大，冷阱壓力提高，同時使幹燥箱的壓力也相應提高。
圖2-7外部摻氣控製的模式圖
這種方法提高了幹燥箱的全壓，改善了傳熱條件和提高了升華界麵的zui高允許溫度，而水蒸汽分壓稍低，有得水蒸汽的逸出，因此可以提高升華速率。
但是：
①熱傳導真空計的標度與氣體成份有關，空氣進入箱內後，其氣體成分不斷變化，特別是解吸幹燥階段與升華階段箱內氣體成分差別較大，引起較大的測量誤差。
②此種方法是利用降低冷阱的冷凝效率來提高箱內壓力的，在開始升華階段有大量的水蒸汽需要捕捉，冷阱效率的降低無疑阻礙了升華速率的進一步提高，因此實際使用中多用於升華後期和解吸幹燥初期。
③此外這種方法在冷阱入口若氣流速度大，冷凝麵上聚集的空氣膜不斷被衝走，因而水蒸汽容易被捕捉凝結：而在氣流後段空氣比例越來越多，凝結阻力越來越大，因而結冰較少。這種凝結表麵結冰的不均勻，甚至可能造成冷阱入口處的氣道阻塞。
2.調節真空泵能力法
它也是基於提高幹燥速率而采用的。其辦法是降低真空泵的抽氣能力或關閉真空泵，使漏入的和從製品中揮發出來的不凝性氣體逐步聚集在冷阱中，以降低冷凝效率，從而提高了冷阱的壓力和幹燥箱的壓力。這種方法提高了箱內全壓，改善了傳熱條件和升華界麵的允許溫度，因而對提高升華速率是有效的，且停真空泵還可以降低運行費用。但熱功當量傳導真空計會出現較大測量誤差，僅控製全壓在一範圍內，造成全壓和水蒸汽分壓控製的不確定性。此外，冷阱結冰也不均勻，其進口處可能造成阻塞。
3． 節流調壓法
對於分離型冷凝器是可能的方式，限製幹燥箱與冷凝器間的真空管道的開度，將幹燥發生的水蒸氣在管道的流路中用閥門、擋板等進行節流，調節水蒸氣流路的阻力係數，用升華的水蒸汽在箱內的集存量來控製箱內壓力表，實現控製幹燥箱真空度。在升華階段箱內全壓和水蒸汽分壓基本相等，因此，這種方法既控製了全壓也控製了水蒸汽分壓，加上擱板溫度的控製，可實現批與批間凍幹條件的再現，冷阱的結冰也較均勻。在*階段幹燥水蒸氣發生期可利用這一方法。
這一方法的優點是：*，僅由箱體發生的水蒸氣來控製，沒有重新從外部導入氣體，所以不需要外部氣體的過濾以及氣體無菌性的驗證。第二、由於在真空管道中將水蒸氣氣體排除掉，冷凝器健全地工作能夠充分發揮其作用。第三，由於在真空管道中將水蒸氣氣體節流來控製真空度，因此，有充分地真空儲蓄。所以即使在zui壞情況負荷時停電發生的情況下，與摻氣控製的情況不同不會立即發生幹燥箱真空度的變化。在冷凝器室的真空壓力劣化到幹燥箱真空壓的一半為止，幹燥箱的真空度保持不變。
其主要問題是：① 由於箱內水蒸汽分壓不能過高，使其全壓也不能進一步提高，這對受傳熱限製階段(如升華前期)增強傳熱不利；②在解吸幹燥階段，解吸了販水蒸汽量很少，節流操作困難。加之此時又希望箱內水蒸汽分壓小，以利於水蒸汽的解吸，所以此法隻適合升華階段的調壓。
2-8 變節流真空控製(升華期)
4、 冷阱溫度調壓法
即用調控冷阱的溫度以控製冷阱的壓力表，從而控製了幹燥箱的壓力。這種方法不是直接控製幹燥箱的壓力，而是用冷阱的溫度間接控製箱內壓力表。在穩定的水蒸汽流時，箱內壓力與冷阱壓力和冷阱溫度之間均存在某種確定的依從關係，因而其控製是可行的。例如解吸幹燥階段，新產生的水蒸汽量較少，冰層亦沒有顯著變化。但在升華階段，升華的水蒸汽流量在不斷變化，冰層厚度亦在不斷變化，這將引起冷阱溫度與冷阱壓力之間依從關係的變化，使其對箱內壓力控製帶來不確定性。
此外要實現冷阱溫度的控製，還需要采用載冷介質間接製冷循環，而這對要求-60oC 左右低溫的冷阱來說，由於增加了一道傳熱溫差損失和增加了循環泵功的加熱，大大增加了所需製冷機的容量和運行能耗。日本共和真空技術采用三重熱交換器冷阱，利用冷熱抵消，較好的實現了冷阱溫度的控製。
